潔凈室最主要之作用在于控制產品（如硅芯片等）所接觸之大氣的潔凈度日及溫濕度，使產品能在一個良好之環境空間中生產、制造，此空間我們稱之為潔凈室。按照國際慣例，無塵凈化級別主要是根據每立方米空氣中粒子直徑大于劃分標準的粒子數量來規定。也就是說所謂無塵并非100%沒有一點灰塵，而是控制在一個非常微量的單位上。當然這個標準中符合灰塵標準的顆粒相對于我們常見的灰塵已經是小的微乎其微，但是對于光學構造而言，哪怕是一點點的灰塵都會產生非常大的負面影響，所以在光學構造產品的生產上，無塵是必然的要求。?
潔凈室的使用要求布局分為:換鞋--一更緩沖--二更洗手消毒--進入潔凈室內；換鞋--一更緩沖--二更洗手消毒--進入潔凈緩沖潔凈走廊--三更緩沖或手消毒--高級別潔凈室二種方式。
實驗室對壓差要求極為嚴格，"三區兩緩"往往要6、7層房間，層層負壓，而且要嚴格保證，無論從設計、施工以及自控上，都是很嚴格的。所以還是要從實際出發，讓生物安全實驗室真正做到安全、實用、經濟、可行。